Hematology:急性髓系白血病内质网应激相关预后模型及免疫细胞浸润的生信分析
时间:2023-06-15 15:51:25 热度:37.1℃ 作者:网络
急性髓系白血病(AML)是起源于造血干细胞的最常见的恶性血液病。据报道,内质网应激(ERs)参与多种肿瘤相关的生物过程。然而,ERs相关基因在AML中的预后作用尚未得到充分研究。一研究团队为了探讨ER应激相关基因的预后价值,揭示其潜在价值,并根据ER应激相关基因的表达水平构建AML的新型预后特征,进行了以下研究。
研究从UCSC Xena网站下载TCGA-LAML RNA-seq数据集作为训练队列。采用单因素Cox回归分析鉴定42个与预后相关的ER应激相关基因。然后,通过LASSO回归分析建立ERs风险评分预后模型。AML患者根据中位风险评分分为高风险组和低风险组。对高危和低危组的Kaplan-Meier生存曲线、时间ROC曲线分析以及单变量和多因素独立预后分析进行了分析。此外,研究团队在TARGET-AML和GSE37642数据集中验证了ERs风险模型。接下来,他们进行了免疫细胞浸润分析,免疫检查点基因表达分析和药物敏感性分析。